Python PipelineLncRNA.buildRefnoncodingGeneSet方法代码示例

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在下文中一共展示了PipelineLncRNA.buildRefnoncodingGeneSet方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: buildRefnoncodingGeneSet

# 需要导入模块: from CGATPipelines import PipelineLncRNA [as 别名]
# 或者: from CGATPipelines.PipelineLncRNA import buildRefnoncodingGeneSet [as 别名]
def buildRefnoncodingGeneSet(infile, outfile):
    '''
    filter the refnoncoding geneset for things that are described in ensembl
    as being:
    Ambiguous_orf
    Retained_intron
    Sense_intronic
    antisense
    Sense_overlapping
    Processed transcript
    '''
    PipelineLncRNA.buildRefnoncodingGeneSet(infile, outfile)

注：本文中的CGATPipelines.PipelineLncRNA.buildRefnoncodingGeneSet方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。