本文整理汇总了Python中RNA.inverse_fold方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python RNA.inverse_fold方法的具体用法?Python RNA.inverse_fold怎么用?Python RNA.inverse_fold使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类RNA
的用法示例。
在下文中一共展示了RNA.inverse_fold方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: inverse_fold
# 需要导入模块: import RNA [as 别名]
# 或者: from RNA import inverse_fold [as 别名]
def inverse_fold():
app.logger.info(request.json);
if not request.json:
abort(400, "Request has no json.")
if 'struct' not in request.json:
abort(400, "Request has no structure in the json.")
if re.match("^[\(\)\.]+$", request.json['struct']) is None:
abort(400, "Invalid structure for inverse fold: {}".format(request.json['struct']))
try:
pt = fus.dotbracket_to_pairtable(str(request.json['struct']))
except Exception as ex:
app.logger.exception(ex)
abort(400, "Unbalanced brackets: {}".format(ex))
result = RNA.inverse_fold("", str(request.json['struct']))[0]
return json.dumps(result), 201