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Python RNA.inverse_fold方法代码示例

本文整理汇总了Python中RNA.inverse_fold方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python RNA.inverse_fold方法的具体用法?Python RNA.inverse_fold怎么用?Python RNA.inverse_fold使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在RNA的用法示例。


在下文中一共展示了RNA.inverse_fold方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: inverse_fold

# 需要导入模块: import RNA [as 别名]
# 或者: from RNA import inverse_fold [as 别名]
    def inverse_fold():
        app.logger.info(request.json);
        if not request.json:
            abort(400, "Request has no json.")

        if 'struct' not in request.json:
            abort(400, "Request has no structure in the json.")

        if re.match("^[\(\)\.]+$", request.json['struct']) is None:
            abort(400, "Invalid structure for inverse fold: {}".format(request.json['struct']))
        
        try:
            pt = fus.dotbracket_to_pairtable(str(request.json['struct'])) 
        except Exception as ex:
            app.logger.exception(ex)
            abort(400, "Unbalanced brackets: {}".format(ex))

        result = RNA.inverse_fold("", str(request.json['struct']))[0]
        return json.dumps(result), 201
开发者ID:mnori,项目名称:forna,代码行数:21,代码来源:forna_server.py


注:本文中的RNA.inverse_fold方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。