本文整理汇总了Python中RNA.energy_of_structure方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python RNA.energy_of_structure方法的具体用法？Python RNA.energy_of_structure怎么用？Python RNA.energy_of_structure使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类RNA的用法示例。
在下文中一共展示了RNA.energy_of_structure方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: cofold_noLP_energy
# 需要导入模块: import RNA [as 别名]
# 或者: from RNA import energy_of_structure [as 别名]
def cofold_noLP_energy(ss, seq, noLC=False):
""" Correct cofold energies returned from RNAsubopt """
if noLC and ((re.search(re.escape('.(&'), ss) or
re.search(re.escape('&).'), ss) or
re.search(re.escape('&(.'), ss) or
re.search(re.escape('.)&'), ss))):
return None
if seq:
bup = RNA.cvar.cut_point
[r1, r2] = seq.split('&')
[s1, s2] = ss.split('&')
RNA.cvar.cut_point = len(r1) + 1
en = RNA.energy_of_structure(r1 + r2, s1 + s2, 0)
RNA.cvar.cut_point = bup
return en