本文整理汇总了Python中RNA.basepair方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python RNA.basepair方法的具体用法?Python RNA.basepair怎么用?Python RNA.basepair使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类RNA
的用法示例。
在下文中一共展示了RNA.basepair方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: bt
# 需要导入模块: import RNA [as 别名]
# 或者: from RNA import basepair [as 别名]
def bt(i,j,k,l,d,data=None):
"""
The backtracking callback must return a list of base pairs
Here, the base pairs may be given in one of the three ways
shown below:
"""
if d == RNA.DECOMP_PAIR_HP:
"""
1. We create a list of dictionaries with 'i' and 'j'
keys that specify the coordinates of the base pair (i,j)
"""
bp = { 'i' : i+1, 'j' : j-1 }
"""
2. We create a list of tuples (i,j)
"""
bp = (i+1, j-1)
"""
3. We create a list of RNA::basepair objects
"""
bp = RNA.basepair()
bp.i = i+1
bp.j = j-1
return [ bp ]
return None