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Python Analysis.store_energies方法代码示例

本文整理汇总了Python中Analysis.store_energies方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Analysis.store_energies方法的具体用法?Python Analysis.store_energies怎么用?Python Analysis.store_energies使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Analysis的用法示例。


在下文中一共展示了Analysis.store_energies方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: range

# 需要导入模块: import Analysis [as 别名]
# 或者: from Analysis import store_energies [as 别名]
    #n = 5
    #alph = 'f'
    an.chains_to_xyz(chains, 'InitDual_'+str(n)+alph, lattice)

    for i in range(0,int(n)):
        rando = rnd.uniform(0,1)
        if rando>.66:
            (lattice, chains,total_energy, acc) = TM.cbmc(lattice,chains)
            print "CBMC"
        elif rando > .33:
            (lattice, chains, total_energy, acc) = TM.take_empty(lattice, chains, graft_points)
            print "Empty"
        else:
            (lattice, chains, total_energy, acc) = TM.swap(lattice, chains)
            print "SWAP"
        an.store_energies(total_energy, n, alph)

        # Should add matrices for chemical moeity and identity in here

        if i % 100 == 0: # record every hundredth configuration
            an.chains_to_xyz(chains, 'LongDual_'+str(n)+alph, lattice)
        count += acc
        an.acceptance_rate(i+1,count)

    an.chains_to_xyz(chains, 'ShortDual_'+str(n)+alph, lattice)

    analysis = an.sep_analysis(chains)
    analysis = tuple(x/float(sum(analysis)) for x in analysis)
    print analysis

    fig = plt.figure()
开发者ID:smerz1989,项目名称:scf-mc,代码行数:33,代码来源:scf-mc-3d.py


注:本文中的Analysis.store_energies方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。