本文整理汇总了Python中Analysis.plot方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Analysis.plot方法的具体用法?Python Analysis.plot怎么用?Python Analysis.plot使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Analysis
的用法示例。
在下文中一共展示了Analysis.plot方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: open
# 需要导入模块: import Analysis [as 别名]
# 或者: from Analysis import plot [as 别名]
print 'Processing trajectory...',
sampler.traj.process() # compute averages, etc.
print '...Done.'
print 'Writing results...',
sampler.traj.write_results(os.path.join(outdir,'traj_lambda%2.2f.npz'%lam))
print '...Done.'
sampler.traj.read_results(os.path.join(outdir,'traj_lambda%2.2f.npz'%lam))
print 'Pickling the sampler object ...',
outfilename = 'sampler_lambda%2.2f.pkl'%lam
print outfilename,
fout = open(os.path.join(outdir, outfilename), 'wb')
# Pickle dictionary using protocol 0.
cPickle.dump(sampler, fout)
fout.close()
print '...Done.'
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# Let's do analysis using MBAR and plot figures
############ MBAR and Figures ###########
# Specify necessary argument values
A = Analysis(100,dataFiles,outdir)
A.plot()