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C++ SequenceTree::partition方法代码示例

本文整理汇总了C++中SequenceTree::partition方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ SequenceTree::partition方法的具体用法?C++ SequenceTree::partition怎么用?C++ SequenceTree::partition使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在SequenceTree的用法示例。


在下文中一共展示了SequenceTree::partition方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: choose_SPR_target

int choose_SPR_target(SequenceTree& T1, int b1_)
{
    const_branchview b1 = T1.directed_branch(b1_);

    //----- Select the branch to move to ------//
    dynamic_bitset<> subtree_nodes = T1.partition(b1.reverse());
    subtree_nodes[b1.target()] = true;

    vector<int> branches;
    vector<double> lengths;

    for(int i=0; i<T1.n_branches(); i++)
    {
        const_branchview bi = T1.branch(i);

        // skip branch if its contained in the subtree
        if (subtree_nodes[bi.target()] and
                subtree_nodes[bi.source()])
            continue;

        double L = 1.0;

        // down-weight branch if it is one of the subtree's 2 neighbors
        if (subtree_nodes[bi.target()] or
                subtree_nodes[bi.source()])
            L = 0.5;

        branches.push_back(i);
        lengths.push_back(L);
    }

    int b2 = branches[ choose(lengths) ];

    return b2;
}
开发者ID:msuchard,项目名称:BAli-Phy,代码行数:35,代码来源:sample-topology-SPR.C

示例2: partition_from_branch

Partition partition_from_branch(const SequenceTree& T,int b) 
{
  dynamic_bitset<> group(T.n_leaves());
  const dynamic_bitset<>& with_internal = T.partition(b);

  for(int i=0;i<group.size();i++)
    group[i] = with_internal[i];

  return Partition(T.get_leaf_labels(), group);
}
开发者ID:sibonli,项目名称:BAli-Phy,代码行数:10,代码来源:partition.C


注:本文中的SequenceTree::partition方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。