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C++ MultidimArray::copy方法代码示例

本文整理汇总了C++中MultidimArray::copy方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ MultidimArray::copy方法的具体用法?C++ MultidimArray::copy怎么用?C++ MultidimArray::copy使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在MultidimArray的用法示例。


在下文中一共展示了MultidimArray::copy方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: processInprocessInputPrepareSPTH


//.........这里部分代码省略.........
        //String name = "[email protected]/Extracted/run_002/extra/BPV_1386.stk";
        String name = "[email protected]/Extracted/run_001/extra/KLH_Dataset_I_Training_0028.stk";
        //String name = "[email protected]/Extracted/run_001/DefaultFamily5";

        std::cout << img.name() << std::endl;

        if (img.name()==name2)
        {
            FileName fpName    = "test_1.txt";
            mI.write(fpName);
            fpName    = "test_2.txt";
            nI.write(fpName);
            fpName    = "test_3.txt";
            tempM.write(fpName);
            fpName    = "test_4.txt";
            ROI.write(fpName);
            //exit(1);
        }
#endif
        nI.binarize(0);
        int im = labelImage2D(nI,nI,8);
        compute_hist(nI, hist, 0, im, im+1);
        size_t l;
        int k,i,j;
        hist.maxIndex(l,k,i,j);
        A1D_ELEM(hist,j)=0;
        hist.maxIndex(l,k,i,j);
        nI.binarizeRange(j-1,j+1);

        double x0=0,y0=0,majorAxis=0,minorAxis=0,ellipAng=0;
        size_t area=0;
        fitEllipse(nI,x0,y0,majorAxis,minorAxis,ellipAng,area);

        A1D_ELEM(v2,0)=majorAxis/((img().xdim) );
        A1D_ELEM(v2,1)=minorAxis/((img().xdim) );
        A1D_ELEM(v2,2)= (fabs((img().xdim)/2-x0)+fabs((img().ydim)/2-y0))/((img().xdim)/2);
        A1D_ELEM(v2,3)=area/( (double)((img().xdim)/2)*((img().ydim)/2) );

        for (int n=0 ; n < numDescriptors2 ; n++)
        {
            if ( std::isnan(std::abs(A1D_ELEM(v2,n))))
                A1D_ELEM(v2,n)=0;
        }

        tempPcaAnalyzer2.addVector(v2);

        //mI.setXmippOrigin();
        //auto_correlation_matrix(mI*ROI,autoCorr);
        //auto_correlation_matrix(nI,autoCorr);
        autoCorr.window(smallAutoCorr,-5,-5, 5, 5);
        smallAutoCorr.copy(temp);
        svdcmp(temp,U,D,V);

        for (int n = 0; n < numDescriptors3; ++n)
            A1D_ELEM(v3,n)=(float)VEC_ELEM(D,n); //A1D_ELEM(v3,n)=(float)VEC_ELEM(D,n)/VEC_ELEM(D,0);

        tempPcaAnalyzer3.addVector(v3);


        double minVal=0.;
        double maxVal=0.;
        mI.computeDoubleMinMax(minVal,maxVal);
        compute_hist(mI, hist, minVal, maxVal, 100);

        for (int n=0 ; n <= numDescriptors4-1 ; n++)
        {
            A1D_ELEM(v4,n)= (hist.percentil((n+1)*10));
        }
        tempPcaAnalyzer4.addVector(v4);

#ifdef DEBUG

        if (img.name()==name1)
        {
            FileName fpName    = "test.txt";
            mI.write(fpName);
            fpName    = "test3.txt";
            nI.write(fpName);
        }
#endif
        imgno++;
        imgnoPCA++;

        if (imgno % c == 0 && verbose>0)
            progress_bar(imgno);
    }

    tempPcaAnalyzer0.evaluateZScore(2,20,trained);
    tempPcaAnalyzer1.evaluateZScore(2,20,trained);
    tempPcaAnalyzer2.evaluateZScore(2,20,trained);
    tempPcaAnalyzer3.evaluateZScore(2,20,trained);
    tempPcaAnalyzer4.evaluateZScore(2,20,trained);

    pcaAnalyzer.push_back(tempPcaAnalyzer0);
    pcaAnalyzer.push_back(tempPcaAnalyzer1);
    pcaAnalyzer.push_back(tempPcaAnalyzer1);
    pcaAnalyzer.push_back(tempPcaAnalyzer3);
    pcaAnalyzer.push_back(tempPcaAnalyzer4);

}
开发者ID:azazellochg,项目名称:scipion,代码行数:101,代码来源:image_sort_by_statistics.cpp


注:本文中的MultidimArray::copy方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。