R qqnorm.lme lme 對象的殘差或隨機效應的正態圖

R語言 qqnorm.lme 位於 nlme 包(package)。

說明

獲得用於評估線性混合效應擬合中殘差和隨機效應的正態性的診斷圖。 form 參數為繪圖規範類型提供了相當大的靈活性。根據網格顯示，條件表達式(位於 | 運算符的右側)始終意味著針對條件因子的每個級別使用不同的麵板。

用法

## S3 method for class 'lme'
qqnorm(y, form, abline, id, idLabels, grid, ...)

參數

`y`	繼承自類 `"lme"` 的對象，表示擬合的線性混合效應模型，或繼承自類 `"lmList"` 的對象，表示 `lm` 對象的列表，或繼承自類 `"lm"` 的對象，表示擬合的線性模型，或繼承自類 `"nls"` ，表示非線性最小二乘擬合模型。
`form`	一個可選的單邊公式，指定所需的繪圖類型。可以引用用於獲取`y`的原始數據幀中存在的任何變量。另外，`y`本身可以在公式中使用符號`"."`引用。 `\|` 運算符右側的條件表達式可用於定義網格顯示中的單獨麵板。 `form` 右側和 `\|` 運算符左側的表達式必須計算為殘差向量或隨機效應矩陣。默認值為 `~ resid(., type = "p")` ，對應於在嵌套最內層評估的標準化殘差的正態圖。
`abline`	可選數值或長度為 2 的數值向量。如果作為單個值給出，則水平線將添加到該坐標處的繪圖中；否則，如果作為向量給出，則其值將用作添加到繪圖中的線的截距和斜率。如果缺失，則不會將任何線條添加到圖中。
`id`	可選數值或片麵公式。如果作為值給出，則將其用作標準化殘差(隨機效應)的雙邊離群值檢驗的顯著性水平。使用 `idLabels` 在圖中識別絕對標準化殘差(隨機效應)大於標準正態分布的 `1 - value/2` 分位數的觀測值。如果作為單邊公式給出，則其右側必須求值為邏輯向量、整數向量或字符向量，用於識別圖中的觀測值。如果缺失，則無法識別任何觀察結果。
`idLabels`	可選向量或片麵公式。如果作為向量給出，它將轉換為字符並用於標記根據 `id` 識別的觀察結果。如果作為單邊公式給出，則其右側必須計算為一個向量，該向量將轉換為字符並用於標記已識別的觀察結果。默認值是最裏麵的分組因子。
`grid`	一個可選的邏輯值，指示是否應將網格添加到繪圖中。默認為 `FALSE` 。
`...`	傳遞給網格圖函數的可選參數。

值

用於評估殘差或隨機效應的正態性的診斷網格圖。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
## normal plot of standardized residuals by gender
qqnorm(fm1, ~ resid(., type = "p") | Sex, abline = c(0, 1))
## normal plots of random effects
qqnorm(fm1, ~ranef(.))

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

也可以看看

lme , plot.lme

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Normal Plot of Residuals or Random Effects from an lme Object。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。