Python MinHash.add_protein方法代碼示例

本文整理匯總了Python中sourmash._minhash.MinHash.add_protein方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python MinHash.add_protein方法的具體用法？Python MinHash.add_protein怎麽用？Python MinHash.add_protein使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類sourmash._minhash.MinHash的用法示例。

在下文中一共展示了MinHash.add_protein方法的3個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_bytes_protein

# 需要導入模塊: from sourmash._minhash import MinHash [as 別名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 別名]
def test_bytes_protein(track_abundance):
    # verify that we can hash protein/aa sequences
    mh = MinHash(10, 6, True, track_abundance=track_abundance)
    mh.add_protein('AGYYG')
    mh.add_protein(u'AGYYG')
    mh.add_protein(b'AGYYG')

    assert len(mh.get_mins()) == 4

開發者ID:dib-lab，項目名稱:sourmash，代碼行數:10，代碼來源:test__minhash.py

示例2: test_basic_dna_bad_2

# 需要導入模塊: from sourmash._minhash import MinHash [as 別名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 別名]
def test_basic_dna_bad_2(track_abundance):
    # test behavior on bad DNA
    mh = MinHash(1, 6, track_abundance=track_abundance)

    with pytest.raises(ValueError):
        mh.add_protein('YYYY')

開發者ID:dib-lab，項目名稱:sourmash，代碼行數:8，代碼來源:test__minhash.py

示例3: test_protein_short

# 需要導入模塊: from sourmash._minhash import MinHash [as 別名]
# 或者: from sourmash._minhash.MinHash import add_protein [as 別名]
def test_protein_short(track_abundance):
    # verify that we can hash protein/aa sequences
    mh = MinHash(10, 9, True, track_abundance=track_abundance)
    mh.add_protein('AG')

    assert len(mh.get_mins()) == 0, mh.get_mins()

開發者ID:dib-lab，項目名稱:sourmash，代碼行數:8，代碼來源:test__minhash.py

注：本文中的sourmash._minhash.MinHash.add_protein方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台，相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目，源碼版權歸原作者所有，傳播和使用請參考對應項目的License；未經允許，請勿轉載。