lme.groupedData
位于 nlme
包(package)。 说明
formula(fixed)
中的响应变量和主要协变量用于构建固定效应模型公式。此公式和 groupedData
对象作为 fixed
和 data
参数以及函数调用中的任何其他附加参数传递给 lme.formula
。有关该函数的说明,请参阅 lme.formula
的文档。
用法
## S3 method for class 'groupedData'
lme(fixed, data, random, correlation, weights,
subset, method, na.action, control, contrasts, keep.data = TRUE)
参数
fixed |
继承自类 |
data |
包含此参数是为了与通用函数保持一致。在此方法函数中它被忽略。 |
random |
可选地,以下任何一项:(i) |
correlation |
说明组内相关结构的可选 |
weights |
可选的 |
subset |
一个可选表达式,指示应在拟合中使用的 |
method |
一个字符串。如果 |
na.action |
一个函数,指示当数据包含 |
control |
估计算法的控制值列表,用于替换函数 |
contrasts |
可选列表。请参阅 |
keep.data |
逻辑: |
值
代表线性混合效应模型拟合的 lme
类的对象。 print
、 plot
和 summary
等通用函数具有显示拟合结果的方法。有关配合的组成部分,请参阅lmeObject
。函数 resid
、 coef
、 fitted
、 fixed.effects
和 random.effects
可用于提取其某些组件。
例子
fm1 <- lme(Orthodont)
summary(fm1)
作者
José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu
参考
The computational methods follow on the general framework of Lindstrom,
M.J. and Bates, D.M. (1988). The model formulation is described in
Laird, N.M. and Ware, J.H. (1982). The variance-covariance
parametrizations are described in Pinheiro, J.C. and Bates., D.M.
(1996). The different correlation structures available for the
correlation
argument are described in Box, G.E.P., Jenkins,
G.M., and Reinsel G.C. (1994), Littel, R.C., Milliken, G.A., Stroup,
W.W., and Wolfinger, R.D. (1996), and Venables, W.N. and Ripley,
B.D. (2002). The use of variance functions for linear and nonlinear
mixed effects models is presented in detail in Davidian, M. and
Giltinan, D.M. (1995).
Box, G.E.P., Jenkins, G.M., and Reinsel G.C. (1994) "Time Series Analysis: Forecasting and Control", 3rd Edition, Holden-Day.
Davidian, M. and Giltinan, D.M. (1995) "Nonlinear Mixed Effects Models for Repeated Measurement Data", Chapman and Hall.
Laird, N.M. and Ware, J.H. (1982) "Random-Effects Models for Longitudinal Data", Biometrics, 38, 963-974.
Lindstrom, M.J. and Bates, D.M. (1988) "Newton-Raphson and EM Algorithms for Linear Mixed-Effects Models for Repeated-Measures Data", Journal of the American Statistical Association, 83, 1014-1022.
Littel, R.C., Milliken, G.A., Stroup, W.W., and Wolfinger, R.D. (1996) "SAS Systems for Mixed Models", SAS Institute.
Pinheiro, J.C. and Bates., D.M. (1996) "Unconstrained Parametrizations for Variance-Covariance Matrices", Statistics and Computing, 6, 289-296.
Pinheiro, J.C., and Bates, D.M. (2000) "Mixed-Effects Models in S and S-PLUS", Springer.
Venables, W.N. and Ripley, B.D. (2002) "Modern Applied Statistics with S", 4th Edition, Springer-Verlag.
也可以看看
lme
, groupedData
, lmeObject
相关用法
- R lme.lmList LME 适合 lmList 对象
- R lmeControl 指定 lme Fit 的控制值
- R lmeStruct 线性混合效应结构
- R lme 线性混合效应模型
- R lmList 具有通用模型的 lm 对象列表
- R lmList.groupedData lmList 根据 groupedData 对象拟合
- R logLik.glsStruct glsStruct 对象的对数似然
- R logLik.lme lme 对象的对数似然
- R logLik.varFunc 提取 varFunc logLik
- R logLik.reStruct 计算重构对数似然
- R logDet.corStruct 提取结构对数行列式
- R logDet.reStruct 提取重构对数行列式
- R logLik.corStruct 提取结构对数似然
- R logLik.lmeStruct lmeStruct 对象的对数似然
- R logDet 提取行列式的对数
- R logLik.gnlsStruct gnlsStruct 对象的对数似然
- R logLik.lmList lmList 对象的对数似然
- R logDet.pdMat 从 pdMat 对象中提取对数行列式
- R logLik.gnls gnls 对象的对数似然
- R Pixel X 射线像素强度随时间的变化
- R corARMA ARMA(p,q) 相关结构
- R getGroupsFormula 提取分组公式
- R corRatio 有理二次相关结构
- R intervals.lmList lmList 系数的置信区间
- R corLin 线性相关结构
注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 LME fit from groupedData Object。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。