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Python cucim.skimage.color.combine_stains用法及代码示例


用法:

cucim.skimage.color.combine_stains(stains, conv_matrix)

染色到 RGB 颜色空间转换。

参数：

stains：(…, 3) 数组

染色颜色空间中的图像。最终维度表示渠道。

conv_matrix: ndarray：

G. Landini [1] 说明的污点分离矩阵。

返回：

out：(..., 3) ndarray

RGB 格式的图像。与输入相同的尺寸。

抛出：

ValueError

如果 stains 不是至少具有形状 (..., 3) 的二维。

注意：

color 模块中可用的染色组合矩阵及其各自的色彩空间：

  • rgb_from_hed：苏木精 + 曙红 + DAB
  • rgb_from_hdx : 苏木精 + DAB
  • rgb_from_fgx : Feulgen + 浅绿色
  • rgb_from_bex：吉姆萨染色剂：甲基蓝 + 曙红
  • rgb_from_rbd : FastRed + FastBlue + DAB
  • rgb_from_gdx：甲基绿 + DAB
  • rgb_from_hax：苏木精 + AEC
  • rgb_from_bro：蓝色矩阵苯胺蓝+红色矩阵偶氮胭脂红+橙色矩阵Orange-G
  • rgb_from_bpx : 甲基蓝 + 丽春红
  • rgb_from_ahx : 阿新蓝 + 苏木精
  • rgb_from_hpx : 苏木精 + PAS

参考：

1

https://web.archive.org/web/20160624145052/http://www.mecourse.com/landinig/software/cdeconv/cdeconv.html

2

A. C. Ruifrok and D. A. Johnston, “Quantification of histochemical staining by color deconvolution,” Anal. Quant. Cytol. Histol., vol. 23, no. 4, pp. 291-299, Aug. 2001.

例子：

>>> import cupy as cp
>>> from skimage import data
>>> from cucim.skimage.color import (separate_stains, combine_stains,
...                                    hdx_from_rgb, rgb_from_hdx)
>>> ihc = cp.array(data.immunohistochemistry())
>>> ihc_hdx = separate_stains(ihc, hdx_from_rgb)
>>> ihc_rgb = combine_stains(ihc_hdx, rgb_from_hdx)

相关用法


注：本文由纯净天空筛选整理自rapids.ai大神的英文原创作品 cucim.skimage.color.combine_stains。非经特殊声明，原始代码版权归原作者所有，本译文未经允许或授权，请勿转载或复制。