本文整理汇总了Python中sklearn.manifold.TSNE.groupby方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TSNE.groupby方法的具体用法？Python TSNE.groupby怎么用？Python TSNE.groupby使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类sklearn.manifold.TSNE的用法示例。
在下文中一共展示了TSNE.groupby方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: TSNE
# 需要导入模块: from sklearn.manifold import TSNE [as 别名]
# 或者: from sklearn.manifold.TSNE import groupby [as 别名]
ord = ord.sort_values(ascending=False)
plt.figure(figsize=(8, 7))
plt.axhline(0, c="black")
ax = sns.pointplot(x="name", y="tot_flux", hue="metabolite",
data=scfa[scfa.name.isin(ord.index[ord > 1])], ci="sd",
order=ord.index[ord > 1], join=False, dodge=True)
ax.grid(axis="x", color="gainsboro")
ax.xaxis.set_tick_params(rotation=90)
sns.despine(left=True, bottom=True)
plt.xlabel("")
plt.tight_layout()
plt.savefig("scfas.svg")
plt.close()
mat = fluxes.pivot("taxa", "reaction", "flux").fillna(0.0)
taxa = mat.index.str.split("_").str[0]
tsne = TSNE(n_components=2).fit_transform(mat)
tsne = pd.DataFrame(tsne, columns=["x", "y"], index=mat.index)
tsne["taxa"] = taxa
sns.set(font_scale=1.5, style="ticks")
g = sns.FacetGrid(tsne, hue="taxa", size=10, aspect=16/10)
gm = g.map(plt.scatter, "x", "y", alpha=0.25)
means = tsne.groupby(taxa).agg("median").reset_index()
texts = means.apply(lambda df: plt.text(df.x, df.y, df.taxa, alpha=0.65),
axis=1)
texts = adjust_text(texts, force_text=(0.02, 0.5),
arrowprops=dict(arrowstyle='-|>', alpha=0.5, color="k"))
plt.savefig("individual_media.png", dpi=200)
plt.close()