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Python Score.get方法代码示例

本文整理汇总了Python中score.Score.get方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Score.get方法的具体用法?Python Score.get怎么用?Python Score.get使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在score.Score的用法示例。


在下文中一共展示了Score.get方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: ponderateFrequencyMatrix

# 需要导入模块: from score import Score [as 别名]
# 或者: from score.Score import get [as 别名]
def ponderateFrequencyMatrix(groups):
    """
    Return the weighted matrix for the groups
    """
    matrix = Score()
    length = len(groups[0][0])
    for i in range(length):
        for iGroup, group in enumerate(groups):
            for seq in group:
                aa1 = seq[i]
                for iOtherGroup, otherGroup in enumerate(groups):
                    if iGroup != iOtherGroup:
                        for otherSeq in otherGroup:
                            aa2 = otherSeq[i]
                            freq = (1 / len(group)) * (1 / len(otherGroup))
                            if aa1 == aa2:
                                freq = freq / 2
                            matrix[aa1, aa2] = matrix.get((aa1, aa2), 0) + freq
    return matrix
开发者ID:etnarek,项目名称:info-f-208,代码行数:21,代码来源:blosum.py


注:本文中的score.Score.get方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。