Python AlignmentSet.readsInRange方法代码示例

本文整理汇总了Python中pbcore.io.AlignmentSet.readsInRange方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python AlignmentSet.readsInRange方法的具体用法？Python AlignmentSet.readsInRange怎么用？Python AlignmentSet.readsInRange使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类pbcore.io.AlignmentSet的用法示例。

在下文中一共展示了AlignmentSet.readsInRange方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_alignmentset_index

# 需要导入模块: from pbcore.io import AlignmentSet [as 别名]
# 或者: from pbcore.io.AlignmentSet import readsInRange [as 别名]
 def test_alignmentset_index(self):
     aln = AlignmentSet(upstreamData.getBamAndCmpH5()[1], strict=True)
     reads = aln.readsInRange(aln.refNames[0], 0, 1000)
     self.assertEqual(len(list(reads)), 2)
     self.assertEqual(len(list(aln)), 112)
     self.assertEqual(len(aln.index), 112)

注：本文中的pbcore.io.AlignmentSet.readsInRange方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。