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Python AlignmentSet._split_read_groups方法代码示例

本文整理汇总了Python中pbcore.io.AlignmentSet._split_read_groups方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python AlignmentSet._split_read_groups方法的具体用法?Python AlignmentSet._split_read_groups怎么用?Python AlignmentSet._split_read_groups使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在pbcore.io.AlignmentSet的用法示例。


在下文中一共展示了AlignmentSet._split_read_groups方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_split_read_groups

# 需要导入模块: from pbcore.io import AlignmentSet [as 别名]
# 或者: from pbcore.io.AlignmentSet import _split_read_groups [as 别名]
 def test_split_read_groups(self):
     fn = "/pbi/dept/secondary/siv/testdata/pbcore-unittest/data/combined.alignmentset.xml"
     ds = AlignmentSet(fn)
     self.assertEqual(len(ds), 30)
     ds_rgs = ds._split_read_groups()
     self.assertEqual(sorted([len(ds_rg) for ds_rg in ds_rgs]), [9, 10, 11])
开发者ID:PacificBiosciences,项目名称:pbcore,代码行数:8,代码来源:test_pbdataset_split.py


注:本文中的pbcore.io.AlignmentSet._split_read_groups方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。