本文整理汇总了Python中nipype.MapNode.base_dir方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MapNode.base_dir方法的具体用法？Python MapNode.base_dir怎么用？Python MapNode.base_dir使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类nipype.MapNode的用法示例。
在下文中一共展示了MapNode.base_dir方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: run_bet
# 需要导入模块: from nipype import MapNode [as 别名]
# 或者: from nipype.MapNode import base_dir [as 别名]
def run_bet(T1_image, workdir):
"""Run freesurfer, convert to nidm and extract stats
"""
from nipype import fsl
from nipype import MapNode
strip = MapNode(fsl.BET(), iterfield=['in_file'], name='skullstripper')
strip.inputs.in_file = T1_image
strip.inputs.mesh = True
strip.inputs.mask = True
strip.base_dir = workdir
bet_results = strip.run()
provgraph = bet_results.provenance[0]
for bundle in bet_results.provenance[1:]:
provgraph.add_bundle(bundle)
vol = MapNode(fsl.ImageStats(op_string='-V'), iterfield=['in_file'],
name='volumeextractor')
vol.inputs.in_file = bet_results.outputs.out_file
vol.base_dir = workdir
vol_results = vol.run()
for bundle in vol_results.provenance:
provgraph.add_bundle(bundle)
return provgraph, provgraph.rdf()