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Python Dataset.load_library方法代码示例

本文整理汇总了Python中dataset.Dataset.load_library方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Dataset.load_library方法的具体用法?Python Dataset.load_library怎么用?Python Dataset.load_library使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在dataset.Dataset的用法示例。


在下文中一共展示了Dataset.load_library方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: next_solution

# 需要导入模块: from dataset import Dataset [as 别名]
# 或者: from dataset.Dataset import load_library [as 别名]
def next_solution(current,rotamer_num):
    idx = 0
    l = len(current)
    while idx < l and current[idx] == rotamer_num[idx] - 1:
        idx += 1
    if idx == l:
        return None
    re = [0] * l
    re[idx] = current[idx] + 1
    for i in range(idx+1,l):
        re[i] = current[i]
    return re


data = Dataset("rotamerLibrary", "energyTable")
data.load_library()
data.lib.calc_energy.restype = c_float
current = [0] * data.residue_num

start = time.time()
solution = dict()
count = 0
while current:
    nodes_c = (c_int * len(current))(*current)
    e = data.lib.calc_energy(byref(nodes_c), data.residue_num,
                             byref(data.rotamer_num_c), byref(data.offset_c), byref(data.energy_c));
    solution[e] = current
    current = next_solution(current,data.rotamer_num)
    count += 1
    if count % 10000000 == 0:
        print count
开发者ID:xichuanglian,项目名称:ProteinRedesign,代码行数:33,代码来源:enumerate_all.py


注:本文中的dataset.Dataset.load_library方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。