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Python Pairs.toPartners方法代码示例

本文整理汇总了Python中cogent.struct.rna2d.Pairs.toPartners方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Pairs.toPartners方法的具体用法?Python Pairs.toPartners怎么用?Python Pairs.toPartners使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在cogent.struct.rna2d.Pairs的用法示例。


在下文中一共展示了Pairs.toPartners方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_toPartners

# 需要导入模块: from cogent.struct.rna2d import Pairs [as 别名]
# 或者: from cogent.struct.rna2d.Pairs import toPartners [as 别名]
    def test_toPartners(self):
        """Pairs toPartners() should return a Partners object"""
        a = Pairs([(1,5),(3,4),(6,9),(7,8)]) #normal
        b = Pairs([(0,4),(2,6)]) #pseudoknot
        c = Pairs([(1,6),(3,6),(4,5)]) #conflict

        self.assertEqual(a.toPartners(10),[None,5,None,4,3,1,9,8,7,6])
        self.assertEqual(a.toPartners(13,3),\
        [None,None,None,None,8,None,7,6,4,12,11,10,9])
        assert isinstance(a.toPartners(10),Partners)
        self.assertEqual(b.toPartners(7),[4,None,6,None,0,None,2])
        self.assertRaises(ValueError,c.toPartners,7)
        self.assertEqual(c.toPartners(7,strict=False),[None,None,None,6,5,4,3])

        #raises an error when try to insert something at non-existing indices
        self.assertRaises(IndexError,c.toPartners,0)
开发者ID:carze,项目名称:clovr-base,代码行数:18,代码来源:test_rna2d.py


注:本文中的cogent.struct.rna2d.Pairs.toPartners方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。