本文整理汇总了Python中cogent.seqsim.usage.Rates.fixNegsDiag方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Rates.fixNegsDiag方法的具体用法?Python Rates.fixNegsDiag怎么用?Python Rates.fixNegsDiag使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类cogent.seqsim.usage.Rates
的用法示例。
在下文中一共展示了Rates.fixNegsDiag方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_fixNegsDiag
# 需要导入模块: from cogent.seqsim.usage import Rates [as 别名]
# 或者: from cogent.seqsim.usage.Rates import fixNegsDiag [as 别名]
def test_fixNegsDiag(self):
"""Rates fixNegsDiag should fix negatives by adding to diagonal"""
q = Rates([[-6,2,2,2],[-6,-2,4,4],[2,2,-6,2],[4,4,-2,-6]], RnaPairs)
m = q.fixNegsDiag()._data
self.assertEqual(m,array([[-6,2,2,2],[0,-8,4,4],[2,2,-6,2],[4,4,0,-8]]))