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Python Atom.tag方法代码示例

本文整理汇总了Python中atom.Atom.tag方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Atom.tag方法的具体用法?Python Atom.tag怎么用?Python Atom.tag使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在atom.Atom的用法示例。


在下文中一共展示了Atom.tag方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: open

# 需要导入模块: from atom import Atom [as 别名]
# 或者: from atom.Atom import tag [as 别名]
#Read .pdb file and create Atom objects with corresponding data from file
with open(pdbFilename) as pdbFile:
    pdbLines = pdbFile.readlines()

for line in pdbLines:
   words = str.split(line)
   if len(words) < 1:
       pass
   elif words[0] == "ATOM":
       newAtom = Atom()
       newAtom.resID = words[1]
       newAtom.atomName = words[2]
       newAtom.resName = words[3]
       newAtom.coordinates = [words[5], words[6], words[7]]
       newAtom.bFactor = words[9]
       newAtom.tag = words[10]
       atoms.append(newAtom)


#Read .out file add corresponding mode data from file to existing Atom objects
##This asssumes a very regular formatting after the first VIBRATION keyword.
##It will produce incorrect output if lines are malformed, or if
##the VIBRATION keyword's first appearance is not directly before mode data.
with open(modeFilename) as modeFile:
    modeLines = modeFile.readlines()

currentModeNumber = 0
currentModeFrequency = 0.0
for line in modeLines:
    words = str.split(line)
    if len(words) < 1:
开发者ID:nigeil,项目名称:nmwizConverter,代码行数:33,代码来源:nmwizConverter.py


注:本文中的atom.Atom.tag方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。