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Python Atom.name方法代码示例

本文整理汇总了Python中atom.Atom.name方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Atom.name方法的具体用法?Python Atom.name怎么用?Python Atom.name使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在atom.Atom的用法示例。


在下文中一共展示了Atom.name方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: make_residue

# 需要导入模块: from atom import Atom [as 别名]
# 或者: from atom.Atom import name [as 别名]
def make_residue(key,hydrogens = True):
    """ returns a molecule object with
    default geometry"""

    if not library._aacids.has_key(key):
        raise KeyError, "Residue %s not known" % key
    m = Molecule()
    m.unity = 'A'
    m.resname = key
    for i, entry in enumerate(library._aacids[key]):
        if hydrogens == False and entry[0][0] == 'H':
            continue
        else:
            a = Atom()
            a.id = i+1
            a.name = entry[0]
            a.symbol = a.name[0]
            a.x = entry[1]
            a.occ = 1.
            a.resname = key
            a.m = library._atommass[a.symbol]
            a.unity = 'A'
            m.atoms.append(a)
    return m
开发者ID:esguerra,项目名称:pmx,代码行数:26,代码来源:builder.py


注:本文中的atom.Atom.name方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。