本文整理汇总了Python中ase.neb.NEB.writer方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python NEB.writer方法的具体用法？Python NEB.writer怎么用？Python NEB.writer使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ase.neb.NEB的用法示例。
在下文中一共展示了NEB.writer方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: xrange
# 需要导入模块: from ase.neb import NEB [as 别名]
# 或者: from ase.neb.NEB import writer [as 别名]
image.constraints.append(constraint)
# Displace last image:
for i in xrange(1,8,1):
images[-1].positions[-i] += (d/2, -h1/3, 0)
write('initial.traj', images[0])
# Relax height of Ag atom for initial and final states:
for image in [images[0], images[-1]]:
QuasiNewton(image).run(fmax=0.01)
if 0:
write('initial.pckl', image[0])
write('finial.pckl', image[-1])
# Interpolate positions between initial and final states:
neb.interpolate()
for image in images:
print image.positions[-1], image.get_potential_energy()
traj = PickleTrajectory('mep.traj', 'w')
dyn = FIRE(neb, dt=0.1)
#dyn = MDMin(neb, dt=0.1)
#dyn = QuasiNewton(neb)
dyn.attach(neb.writer(traj))
dyn.run(fmax=0.01,steps=150)
for image in images:
print image.positions[-1], image.get_potential_energy()