本文整理汇总了Python中ase.neb.NEB.climb方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python NEB.climb方法的具体用法？Python NEB.climb怎么用？Python NEB.climb使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类ase.neb.NEB的用法示例。
在下文中一共展示了NEB.climb方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: range
# 需要导入模块: from ase.neb import NEB [as 别名]
# 或者: from ase.neb.NEB import climb [as 别名]
for i in range(nimages):
images.append(images[0].copy())
images[-1].positions[6, 1] = 2 - images[0].positions[6, 1]
neb = NEB(images)
neb.interpolate()
if 0: # verify that initial images make sense
from ase.visualize import view
view(neb.images)
for image in images:
image.set_calculator(MorsePotential())
dyn = BFGS(neb, trajectory='mep.traj') # , logfile='mep.log')
dyn.run(fmax=fmax)
for a in neb.images:
print(a.positions[-1], a.get_potential_energy())
neb.climb = True
dyn.run(fmax=fmax)
# Check NEB tools.
nt_images = read('[email protected]:')
nebtools = NEBtools(nt_images)
nt_fmax = nebtools.get_fmax(climb=True)
Ef, dE = nebtools.get_barrier()
print(Ef, dE, fmax, nt_fmax)
assert nt_fmax < fmax
assert abs(Ef - 1.389) < 0.001