本文整理汇总了Python中Table.Table.left_join方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Table.left_join方法的具体用法?Python Table.left_join怎么用?Python Table.left_join使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Table.Table
的用法示例。
在下文中一共展示了Table.left_join方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1:
# 需要导入模块: from Table import Table [as 别名]
# 或者: from Table.Table import left_join [as 别名]
lnc_gtf=out_dir+"/"+'novel_lincRNA.gtf'
coding_gtf=out_dir+"/"+'novel_coding.gtf'
cnc_gtf=out_dir+"/"+'ambiguous_genes.gtf'
Gene_Info = out_dir + '/compare_2_infor.txt'
###################################
gtf=Gtf(gtf_input)
tid_gid=gtf.get_tid_gid()
#index_content=Table(index_file,0,False)
#index_content.write_to_file('index_content')
#transform_index_content=index_content.cal(index_transform,'row')
#transform_index=Table.build_table(1,['tid','cnc_type','score','start','end','length'],transform_index_content)
transform_index=Table(index_file,1,True)
transform_index.left_join(1,tid_gid,1)
gid_cnctype=transform_index.get_col('gid','index')
gid_cnctype=gid_cnctype.de_redundency()
gid_cnctype=gid_cnctype.key_by('gid','index')
coding=gid_cnctype.eget('union','_index=coding')
noncoding=gid_cnctype.eget('union','_index=noncoding')
ambiguity=gid_cnctype.eget('union','_index=coding,noncoding','_index=noncoding,coding')