本文整理汇总了Python中MDAnalysis.Universe.split方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Universe.split方法的具体用法？Python Universe.split怎么用？Python Universe.split使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类MDAnalysis.Universe的用法示例。
在下文中一共展示了Universe.split方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: process_trajectory
# 需要导入模块: from MDAnalysis import Universe [as 别名]
# 或者: from MDAnalysis.Universe import split [as 别名]
def process_trajectory(args):
start, end = args.region.split('-')
plane = [int(x) for x in args.plane.split(',')]
univ = Universe(args.topo,args.traj)
results = []
for ts in univ.trajectory:
norm = get_normal(univ, atoms=plane)
temp = get_region(univ, start, end)
if norm is not None and temp is not None and len(temp) > 0:
angle = get_vector(temp)
name = univ.split('/')[-1]
if angle is not None:
results.append(dot(norm, angle))
if args.graph and len(results) > 0:
import matplotlib.pyplot as plt
ysort = sorted(list(enumerate(results,start=1)), key=lambda kv: float(kv[1]))
x, y = zip(*ysort)
ind = arange(len(x))
plt.plot(y, ind, color='r')
plt.yticks(ind, x)
print ysort
plt.show()
return