本文整理汇总了Python中MDAnalysis.Universe.load_new方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Universe.load_new方法的具体用法?Python Universe.load_new怎么用?Python Universe.load_new使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类MDAnalysis.Universe
的用法示例。
在下文中一共展示了Universe.load_new方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Universe
# 需要导入模块: from MDAnalysis import Universe [as 别名]
# 或者: from MDAnalysis.Universe import load_new [as 别名]
try:
#uniTraj = Universe(topologyPath, format='PRMTOP')
uniTraj = Universe(topologyPath, format=topoFormat)
except:
print "Error: Could not load topology file"
return 100
try:
#filename, fileExtension = os.path.splitext(trajectoryPath)
#if str.lower(fileExtension)== ".netcdf":
# uniTraj.load_new(trajectoryPath, format='NCDF')
#else:
# uniTraj.load_new(trajectoryPath)
uniTraj.load_new(trajectoryPath, format=trajFormat)
#uniTraj.load_new(trajectoryPath)
except:
print "Error: Could not load trajectory file"
return 200
print "Inserting trajectory"
trajectoryToDB(uniTraj, con, simulationId)
#print len(structIdArray)
if con:
con.close()
print "The program successfully finished"