Python Universe.build_topology方法代码示例

本文整理汇总了Python中MDAnalysis.Universe.build_topology方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Universe.build_topology方法的具体用法？Python Universe.build_topology怎么用？Python Universe.build_topology使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类MDAnalysis.Universe的用法示例。

在下文中一共展示了Universe.build_topology方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_bonds

# 需要导入模块: from MDAnalysis import Universe [as 别名]
# 或者: from MDAnalysis.Universe import build_topology [as 别名]
 def test_bonds(self):
     u = Universe(self.filename, guess_bonds=True)
     # need to force topology to load before querying individual atom bonds
     u.build_topology()
     bonds0 = u.select_atoms("segid B and (altloc A)")[0].bonds
     bonds1 = u.select_atoms("segid B and (altloc B)")[0].bonds
     assert_equal(len(bonds0), len(bonds1))

注：本文中的MDAnalysis.Universe.build_topology方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。