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Python Network.network[gene1]方法代码示例

本文整理汇总了Python中Network.network[gene1]方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Network.network[gene1]方法的具体用法?Python Network.network[gene1]怎么用?Python Network.network[gene1]使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Network的用法示例。


在下文中一共展示了Network.network[gene1]方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: JobManager

# 需要导入模块: import Network [as 别名]
# 或者: from Network import network[gene1] [as 别名]
# Setup job manager
jobman = JobManager(settings)


# Figure out list of dex targets and put them into a network so we can
# compare
net = Network()
net.gene_list = dex_storage.gene_list
target = sys.argv[1]

if target == "At1g25550":
    dex_storage = dex_storage2

for gene1 in dex_storage.gene_list:
    net.network[gene1] = {}
    for gene2 in dex_storage.gene_list:
        net.network[gene1][gene2] = 0
for gene in dex_storage.gene_list:
    print dex_storage.experiments[0].ratios[gene]
    if dex_storage.experiments[0].ratios[gene] >= 2.0:
        print dex_storage.experiments[0].ratios[gene]
        net.network[target][gene] = 1
    elif dex_storage.experiments[0].ratios[gene] <= 0.5:
        net.network[target][gene] = -1
    else:
        net.network[target][gene] = 0



# Run a fresh DFG
开发者ID:ylyhlh,项目名称:Network-Inference-Workspace,代码行数:32,代码来源:compare_to_dex.py


注:本文中的Network.network[gene1]方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。