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Java SAMRecord.getStringAttribute方法代码示例

本文整理汇总了Java中htsjdk.samtools.SAMRecord.getStringAttribute方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Java SAMRecord.getStringAttribute方法的具体用法?Java SAMRecord.getStringAttribute怎么用?Java SAMRecord.getStringAttribute使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在htsjdk.samtools.SAMRecord的用法示例。


在下文中一共展示了SAMRecord.getStringAttribute方法的2个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Java代码示例。

示例1: getBAQTag

import htsjdk.samtools.SAMRecord; //导入方法依赖的package包/类
/**
 * Get the BAQ attribute from the tag in read.  Returns null if no BAQ tag is present.
 * @param read
 * @return
 */
public static byte[] getBAQTag(SAMRecord read) {
    String s = read.getStringAttribute(BAQ_TAG);
    return s != null ? s.getBytes() : null;
}
 
开发者ID:PAA-NCIC,项目名称:SparkSeq,代码行数:10,代码来源:BAQ.java

示例2: hasBAQTag

import htsjdk.samtools.SAMRecord; //导入方法依赖的package包/类
/**
 * Returns true if the read has a BAQ tag, or false otherwise
 * @param read
 * @return
 */
public static boolean hasBAQTag(SAMRecord read) {
    return read.getStringAttribute(BAQ_TAG) != null;
}
 
开发者ID:PAA-NCIC,项目名称:SparkSeq,代码行数:9,代码来源:BAQ.java


注:本文中的htsjdk.samtools.SAMRecord.getStringAttribute方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。