本文整理汇总了C#中Atom.ParseAtomLine方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C# Atom.ParseAtomLine方法的具体用法？C# Atom.ParseAtomLine怎么用？C# Atom.ParseAtomLine使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Atom的用法示例。
在下文中一共展示了Atom.ParseAtomLine方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C#代码示例。
示例1: ReadAtoms
internal virtual bool ReadAtoms(StreamReader pdbStream)
{
List<Atom> auxList = new List<Atom>();
//using (StreamReader pdbReader = new StreamReader(pdbStream))
//{
string pdbLine = pdbStream.ReadLine();
while (pdbLine != null)
{
if (pdbLine.StartsWith("ENDMDL") /*|| pdbLine.StartsWith("TER") */|| pdbLine.StartsWith("END")) break;
if(flagChain==CHAIN_MODE.SINGLE)
if(pdbLine.StartsWith("TER"))
break;
if (pdbLine.StartsWith("ATOM") || pdbLine.StartsWith("HETATM"))
{
if (pdbLine.Contains("\t"))
{
ErrorBase.AddErrors("Error in file: " + ((FileStream)pdbStream.BaseStream).Name + " " + "ATOM line containes tab what is not allowed");
return false;
}
Atom atom = new Atom();
string error=atom.ParseAtomLine(this, pdbLine,flag);
if (error==null)
{
//Check if the atom already exists!!
if (flag == PDBMODE.ONLY_CA || flag == PDBMODE.CA_CB || flag == PDBMODE.ONLY_CB || flag==PDBMODE.ONLY_SEQ)
{
if (flag == PDBMODE.ONLY_CA || flag == PDBMODE.CA_CB || flag == PDBMODE.ONLY_SEQ)
if (atom.AtomName == "CA")
auxList.Add(atom);
if (flag == PDBMODE.ONLY_CB || flag == PDBMODE.CA_CB )//|| (atom.ResidueName=='G' && flag==PDBMODE.ONLY_CA))
if (atom.AtomName == "CB")
auxList.Add(atom);
}
else
auxList.Add(atom);
}
else
ErrorBase.AddErrors("Error in file: " + ((FileStream)pdbStream.BaseStream).Name+" "+error);
}
pdbLine = pdbStream.ReadLine();
}
this.atoms = new List<Atom>(auxList);
// }
return true;
}