本文整理汇总了C++中bam_record::n_cigar方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ bam_record::n_cigar方法的具体用法？C++ bam_record::n_cigar怎么用？C++ bam_record::n_cigar使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bam_record的用法示例。
在下文中一共展示了bam_record::n_cigar方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: endPos
static
void
addReadToDepthEst(
const bam_record& bamRead,
const pos_t beginPos,
std::vector<unsigned>& depth)
{
using namespace ALIGNPATH;
const pos_t endPos(beginPos+depth.size());
// get cigar:
path_t apath;
bam_cigar_to_apath(bamRead.raw_cigar(), bamRead.n_cigar(), apath);
pos_t refPos(bamRead.pos()-1);
BOOST_FOREACH(const path_segment& ps, apath)
{
if (refPos>=endPos) return;
if (MATCH == ps.type)
{
for (pos_t pos(refPos); pos < (refPos+static_cast<pos_t>(ps.length)); ++pos)
{
if (pos>=beginPos)
{
if (pos>=endPos) return;
depth[pos-beginPos]++;
}
}
}
if (is_segment_type_ref_length(ps.type)) refPos += ps.length;
}
}