C++ alignment::convert_to_sequences方法代码示例

本文整理汇总了C++中alignment::convert_to_sequences方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ alignment::convert_to_sequences方法的具体用法？C++ alignment::convert_to_sequences怎么用？C++ alignment::convert_to_sequences使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类alignment的用法示例。

在下文中一共展示了alignment::convert_to_sequences方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: check_leaf_sequences

void check_leaf_sequences(const alignment& A,int n_leaves) {

  vector<sequence> sequences = A.convert_to_sequences();

  const alphabet& a = A.get_alphabet();

  for(int i=0;i<n_leaves;i++) {

    sequences[i].strip_gaps();
    if (not (a(sequences[i]) == a(A.seq(i)))) {
      cerr<<"leaf sequence "<<i<<" corrupted!\n";

      cerr<<"orig: "<<A.seq(i)<<endl;

      cerr<<"new : "<<sequences[i]<<endl;

      std::abort();
    }
  }
}

注：本文中的alignment::convert_to_sequences方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台，相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目，源码版权归原作者所有，传播和使用请参考对应项目的License；未经允许，请勿转载。