本文整理汇总了C++中alignment::add_sequence方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ alignment::add_sequence方法的具体用法?C++ alignment::add_sequence怎么用?C++ alignment::add_sequence使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类alignment
的用法示例。
在下文中一共展示了alignment::add_sequence方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: add_internal
alignment add_internal(alignment A,const Tree& T)
{
// Complain if A and T don't correspond
if (A.n_sequences() != T.n_leaves())
throw myexception()<<"Number of sequence in alignment doesn't match number of leaves in tree"
<<"- can't add internal sequences";
// Add empty sequences
for(int i=T.n_leaves();i<T.n_nodes();i++) {
sequence s;
s.name = string("A") + convertToString(i);
A.add_sequence(s);
}
// Set them to all gaps
for(int column=0;column<A.length();column++)
for(int i=T.n_leaves();i<T.n_nodes();i++)
A(column,i) = alphabet::gap;
return A;
}