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C++ ModelType::getGLD方法代码示例

本文整理汇总了C++中ModelType::getGLD方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ ModelType::getGLD方法的具体用法?C++ ModelType::getGLD怎么用?C++ ModelType::getGLD使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在ModelType的用法示例。


在下文中一共展示了ModelType::getGLD方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: calcExpectedEffectiveLengths

void calcExpectedEffectiveLengths(ModelType& model) {
  int lb, ub, span;
  double *pdf = NULL, *cdf = NULL, *clen = NULL; // clen[i] = sigma_{j=1}^{i}pdf[i]*(lb+i)
  
  model.getGLD().copyTo(pdf, cdf, lb, ub, span);
  clen = new double[span + 1];
  clen[0] = 0.0;
  for (int i = 1; i <= span; i++) {
    clen[i] = clen[i - 1] + pdf[i] * (lb + i);
  }

  eel.clear();
  eel.resize(M + 1, 0.0);
  for (int i = 1; i <= M; i++) {
    int totLen = refs.getRef(i).getTotLen();
    int fullLen = refs.getRef(i).getFullLen();
    int pos1 = max(min(totLen - fullLen + 1, ub) - lb, 0);
    int pos2 = max(min(totLen, ub) - lb, 0);

    if (pos2 == 0) { eel[i] = 0.0; continue; }
    
    eel[i] = fullLen * cdf[pos1] + ((cdf[pos2] - cdf[pos1]) * (totLen + 1) - (clen[pos2] - clen[pos1]));
    assert(eel[i] >= 0);
    if (eel[i] < MINEEL) { eel[i] = 0.0; }
  }
  
  delete[] pdf;
  delete[] cdf;
  delete[] clen;
}
开发者ID:kuod,项目名称:oqtans_tools,代码行数:30,代码来源:EM.cpp


注:本文中的ModelType::getGLD方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。