本文整理汇总了C++中Kmer::ShiftAppend方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：C++ Kmer::ShiftAppend方法的具体用法？C++ Kmer::ShiftAppend怎么用？C++ Kmer::ShiftAppend使用的例子？那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Kmer的用法示例。
在下文中一共展示了Kmer::ShiftAppend方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: RefreshEdges
void ContigGraph::RefreshEdges()
{
BuildBeginKmerMap();
uint64_t total_degree = 0;
#pragma omp parallel for reduction(+: total_degree)
for (int64_t i = 0; i < (int64_t)vertices_.size(); ++i)
{
for (int strand = 0; strand < 2; ++strand)
{
ContigGraphVertexAdaptor current(&vertices_[i], strand);
for (int x = 0; x < 4; ++x)
{
if (current.out_edges()[x])
{
Kmer kmer = current.end_kmer(kmer_size_);
kmer.ShiftAppend(x);
if (FindVertexAdaptorByBeginKmer(kmer).is_null())
current.out_edges().Remove(x);
}
}
//#pragma omp atomic
total_degree += current.out_edges().size();
}
if (vertices_[i].contig().size() == kmer_size_
&& vertices_[i].contig().IsPalindrome())
{
vertices_[i].in_edges() = vertices_[i].out_edges() | vertices_[i].out_edges();
vertices_[i].out_edges() = vertices_[i].in_edges();
}
}
num_edges_ = total_degree / 2;
}