本文整理汇总了C++中Kmer::ReverseComplement方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Kmer::ReverseComplement方法的具体用法?C++ Kmer::ReverseComplement怎么用?C++ Kmer::ReverseComplement使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Kmer
的用法示例。
在下文中一共展示了Kmer::ReverseComplement方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: Check
bool HashGraph::Check()
{
for (int64 i = 0; i < (int64)table_size; ++i)
{
HashNode *node = table[i];
while (node != NULL)
{
KmerNodeAdapter adapter(node);
Kmer kmer = adapter.GetNode()->GetKmer();
for (int strand = 0; strand < 2; ++strand)
{
unsigned edges = adapter.OutEdges();
for (int x = 0; x < 4; ++x)
{
if (edges & (1 << x))
{
Kmer next = kmer;
next.AddRight(x);
KmerNode *q = GetNode(next);
if (q == NULL)
{
cout << "null fail" << endl;
return false;
}
if (q->IsDead())
{
cout << "deadend fail" << endl;
return false;
}
KmerNodeAdapter adp(q, next);
if (((1 << (3 - kmer.GetBase(0))) & adp.InEdges()) == 0)
{
cout << (int)kmer.GetBase(0) << " " << (int)adp.InEdges() << endl;
cout << "no in edge fail" << endl;
return false;
}
}
}
kmer.ReverseComplement();
adapter.ReverseComplement();
}
node = node->next;
}
}
return true;
}