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C++ Kmer::Hash方法代码示例

本文整理汇总了C++中Kmer::Hash方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ Kmer::Hash方法的具体用法?C++ Kmer::Hash怎么用?C++ Kmer::Hash使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Kmer的用法示例。


在下文中一共展示了Kmer::Hash方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: InsertSequence

void HashGraph::InsertSequence(const Sequence &seq, uint64 prefix, uint64 mask)
{
    if (seq.Size() < kmerLength)
        return;

    Kmer kmer;
    for (int i = 0; i < kmerLength-1; ++i)
        kmer.AddRight(seq[i]);
    for (int i = kmerLength-1; i < seq.Size(); ++i)
    {
        kmer.AddRight(seq[i]);
        Kmer key = kmer;
        Kmer rev_comp = kmer;
        rev_comp.ReverseComplement();
        if (rev_comp < kmer)
            key = rev_comp;

        if ((key.Hash() & mask) == prefix)
        {
            KmerNodeAdapter adp(InsertKmer(kmer), kmer);
            if (i >= (int)kmerLength)
            {
                adp.AddInEdge(3 - seq[i-kmerLength]);
            }

            if (i+1 < seq.Size())
            {
                adp.AddOutEdge(seq[i+1]);
            }
        }
    }
}
开发者ID:brettin,项目名称:hku-idba,代码行数:32,代码来源:HashGraph.cpp


注:本文中的Kmer::Hash方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。