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C++ COption::GetIncludedSamples方法代码示例

本文整理汇总了C++中COption::GetIncludedSamples方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ COption::GetIncludedSamples方法的具体用法?C++ COption::GetIncludedSamples怎么用?C++ COption::GetIncludedSamples使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在COption的用法示例。


在下文中一共展示了COption::GetIncludedSamples方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。

示例1: main

int main(int ArgI, char* ArgC[])
{
  COption op;
  
  CRec geneticmap;

  
  for (int i = 0; i != ArgI-1; ++i)
    {
      if (strcmp(ArgC[i], "-interval") == 0 && i + 2 < ArgI) 
	{
	  op.minpos = atoi(ArgC[i+1]);
	  op.maxpos = atoi(ArgC[i+2]);
	}

      if (strcmp(ArgC[i], "-include-variant") == 0) 	  op.fn0 = ArgC[i+1];
      if (strcmp(ArgC[i], "-exclude-vatiant") == 0)	  op.fn1 = ArgC[i+1];
      if (strcmp(ArgC[i], "-genetic-map") == 0) geneticmap.Init(ArgC[i+1]);
      if (strcmp(ArgC[i], "-buffer") == 0) op.intv = atoi(ArgC[i+1]);
      if (strcmp(ArgC[i], "-include-sample") == 0) op.GetIncludedSamples(ArgC[i+1]);
      if (strcmp(ArgC[i], "-exclude-sample") == 0) op.GetExcludedSamples(ArgC[i+1]);
      if (strcmp(ArgC[i], "-output") == 0) op.fnoutput = ArgC[i+1];   
      
    }
	
  op.GetData();

  CData dhap (&op);
  CData dlk (&op);

  for (int i = 0; i != ArgI-1; ++i)
    {
      if (strcmp(ArgC[i], "-hap") == 0) dhap.GetHaplotype(ArgC[i+1]);
      if (strcmp(ArgC[i], "-lk") == 0) dlk.GetLK(ArgC[i+1]);
    }
  
  dhap.MatchData(dlk.GetSamples()); 
  dhap.CM_Location(geneticmap);
  dlk.CM_Location(geneticmap);

  dhap.Estimate_Panel_ID(200); 
  CMCMC mcmc(&dhap, &op, &geneticmap, &dlk);
  
  dlk.Output(op.GetfnOutput());
  return 0;
}
开发者ID:lsquang,项目名称:simHMM,代码行数:46,代码来源:main.cpp


注:本文中的COption::GetIncludedSamples方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。