本文整理汇总了C++中BottomSegmentIteratorPtr::toReverse方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:C++ BottomSegmentIteratorPtr::toReverse方法的具体用法?C++ BottomSegmentIteratorPtr::toReverse怎么用?C++ BottomSegmentIteratorPtr::toReverse使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类BottomSegmentIteratorPtr
的用法示例。
在下文中一共展示了BottomSegmentIteratorPtr::toReverse方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的C++代码示例。
示例1: checkCallBack
void TopSegmentIteratorReverseTest::checkCallBack(const Alignment *alignment) {
BottomSegmentIteratorPtr bi;
TopSegmentIteratorPtr ti, ti2;
const Genome *parent1 = alignment->openGenome("parent1");
const Genome *child1 = alignment->openGenome("child1");
ti = child1->getTopSegmentIterator();
bi = parent1->getBottomSegmentIterator();
ti2 = child1->getTopSegmentIterator();
ti2->toChild(bi, 0);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getStartPosition() == 0);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getLength() == 10);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getReversed() == false);
CuAssertTrue(_testCase, ti2->getStartPosition() == 9);
CuAssertTrue(_testCase, ti2->getLength() == 10);
CuAssertTrue(_testCase, ti2->getReversed() == true);
bi->slice(1, 3);
ti2->toChild(bi, 0);
CuAssertTrue(_testCase, bi->getStartPosition() == 1);
CuAssertTrue(_testCase, bi->getLength() == 6);
CuAssertTrue(_testCase, ti2->getStartPosition() == 8);
CuAssertTrue(_testCase, ti2->getLength() == 6);
string buffer;
bi->getString(buffer);
CuAssertTrue(_testCase, buffer == "CCTACG");
ti2->getString(buffer);
CuAssertTrue(_testCase, buffer == "CACGTA");
bi = child1->getBottomSegmentIterator();
CuAssertTrue(_testCase, bi->getReversed() == false);
ti->toParseUp(bi);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getStartPosition() == 0);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getLength() == 5);
bi->toReverse();
ti->toParseUp(bi);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getStartPosition() == 4);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getLength() == 5);
bi->toReverse();
CuAssertTrue(_testCase, bi->getReversed() == false);
bi->toRight();
ti->toParseUp(bi);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getStartPosition() == 5);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getLength() == 5);
bi->toReverse();
ti->toParseUp(bi);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getStartPosition() == 9);
CuAssertTrue(_testCase, ti->getLength() == 5);
}