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R themis step_upsample 基於因子變量對數據集進行上采樣

step_upsample() 創建配方步驟的規範,該步驟將複製數據集的行,以使特定因子水平中水平的出現次數相等。

用法

step_upsample(
  recipe,
  ...,
  over_ratio = 1,
  ratio = deprecated(),
  role = NA,
  trained = FALSE,
  column = NULL,
  target = NA,
  skip = TRUE,
  seed = sample.int(10^5, 1),
  id = rand_id("upsample")
)

參數

recipe

一個菜譜對象。該步驟將添加到此配方的操作序列中。

...

一個或多個選擇器函數用於選擇使用哪個變量對數據進行采樣。有關更多詳細信息,請參閱selections()。選擇應產生單因子變量。對於tidy 方法,當前未使用這些。

over_ratio

多數頻率與少數頻率之比的數值。默認值 (1) 表示對所有其他級別進行采樣,使其具有與最常出現的級別相同的頻率。值為 0.5 意味著少數級別的行數(最多)(大約)是多數級別的一半。

ratio

已棄用的參數;與 over_ratio 相同。

role

由於沒有創建新變量,因此此步驟未使用。

trained

指示預處理數量是否已估計的邏輯。

column

將由 ... 選擇器(最終)填充的變量名稱的字符串。

target

將用於二次采樣的整數。這不應由用戶設置,並將由 prep 填充。

skip

一個合乎邏輯的。當bake() 烘焙食譜時是否應該跳過此步驟?雖然所有操作都是在 prep() 運行時烘焙的,但某些操作可能無法對新數據進行(例如處理結果變量)。使用skip = TRUE時應小心,因為它可能會影響後續操作的計算。

seed

上采樣時用作種子的整數。

id

該步驟特有的字符串,用於標識它。

recipe 的更新版本,其中新步驟添加到現有步驟(如果有)的序列中。對於 tidy 方法,包含 terms 列的 tibble,它是用於采樣的變量。

細節

上采樣旨在單獨在訓練集上執行。因此,默認值為 skip = TRUE

如果用於定義抽樣的因子變量中存在缺失值,則將以與其他因子水平抽樣相同的方式隨機選擇缺失數據。缺失值不用於確定多數級別的數據量(參見下麵的示例)。

對於因子水平與多數水平出現頻率相同的任何數據,所有數據都將被保留。

數據中的所有列均由 juice()bake() 采樣並返回。

整理

當您tidy()此步驟時,將返回包含列terms(選擇的選擇器或變量)的tibble。

調整參數

此步驟有 1 個調整參數:

  • over_ratio:過采樣率(類型:double,默認值:1)

箱重

此步驟執行可以利用案例權重的無監督操作。要使用它們,請參閱 recipes::case_weights 中的文檔和 tidymodels.org 中的示例。

也可以看看

過采樣的其他步驟:step_adasyn()step_bsmote()step_rose()step_smotenc()step_smote()

例子

library(recipes)
library(modeldata)
data(hpc_data)

hpc_data0 <- hpc_data %>%
  select(-protocol, -day)

orig <- count(hpc_data0, class, name = "orig")
orig
#> # A tibble: 4 × 2
#>   class  orig
#>   <fct> <int>
#> 1 VF     2211
#> 2 F      1347
#> 3 M       514
#> 4 L       259

up_rec <- recipe(class ~ ., data = hpc_data0) %>%
  # Bring the minority levels up to about 1000 each
  # 1000/2211 is approx 0.4523
  step_upsample(class, over_ratio = 0.4523) %>%
  prep()

training <- up_rec %>%
  bake(new_data = NULL) %>%
  count(class, name = "training")
training
#> # A tibble: 4 × 2
#>   class training
#>   <fct>    <int>
#> 1 VF        2211
#> 2 F         1347
#> 3 M         1000
#> 4 L         1000

# Since `skip` defaults to TRUE, baking the step has no effect
baked <- up_rec %>%
  bake(new_data = hpc_data0) %>%
  count(class, name = "baked")
baked
#> # A tibble: 4 × 2
#>   class baked
#>   <fct> <int>
#> 1 VF     2211
#> 2 F      1347
#> 3 M       514
#> 4 L       259

# Note that if the original data contained more rows than the
# target n (= ratio * majority_n), the data are left alone:
orig %>%
  left_join(training, by = "class") %>%
  left_join(baked, by = "class")
#> # A tibble: 4 × 4
#>   class  orig training baked
#>   <fct> <int>    <int> <int>
#> 1 VF     2211     2211  2211
#> 2 F      1347     1347  1347
#> 3 M       514     1000   514
#> 4 L       259     1000   259

library(ggplot2)

ggplot(circle_example, aes(x, y, color = class)) +
  geom_point() +
  labs(title = "Without upsample")


recipe(class ~ x + y, data = circle_example) %>%
  step_upsample(class) %>%
  prep() %>%
  bake(new_data = NULL) %>%
  ggplot(aes(x, y, color = class)) +
  geom_jitter(width = 0.1, height = 0.1) +
  labs(title = "With upsample (with jittering)")

源代碼:R/upsample.R

相關用法


注:本文由純淨天空篩選整理自大神的英文原創作品 Up-Sample a Data Set Based on a Factor Variable。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。