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Python MoleculeMatcher.group_molecules方法代碼示例

本文整理匯總了Python中pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher.group_molecules方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題:Python MoleculeMatcher.group_molecules方法的具體用法?Python MoleculeMatcher.group_molecules怎麽用?Python MoleculeMatcher.group_molecules使用的例子?那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher的用法示例。


在下文中一共展示了MoleculeMatcher.group_molecules方法的1個代碼示例,這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚,您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_group_molecules

# 需要導入模塊: from pymatgen.analysis.molecule_matcher import MoleculeMatcher [as 別名]
# 或者: from pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher import group_molecules [as 別名]
 def test_group_molecules(self):
     mm = MoleculeMatcher(tolerance=0.001)
     with open(os.path.join(test_dir, "mol_list.txt")) as f:
         filename_list = [line.strip() for line in f.readlines()]
     mol_list = [Molecule.from_file(os.path.join(test_dir, f))
                 for f in filename_list]
     mol_groups = mm.group_molecules(mol_list)
     filename_groups = [[filename_list[mol_list.index(m)] for m in g]
                        for g in mol_groups]
     with open(os.path.join(test_dir, "grouped_mol_list.txt")) as f:
         grouped_text = f.read().strip()
     self.assertEqual(str(filename_groups), grouped_text)
開發者ID:AtlasL,項目名稱:pymatgen,代碼行數:14,代碼來源:test_molecule_matcher.py


注:本文中的pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher.group_molecules方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台,相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目,源碼版權歸原作者所有,傳播和使用請參考對應項目的License;未經允許,請勿轉載。