本文整理匯總了Python中pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher.get_rmsd方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python MoleculeMatcher.get_rmsd方法的具體用法？Python MoleculeMatcher.get_rmsd怎麽用？Python MoleculeMatcher.get_rmsd使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher的用法示例。
在下文中一共展示了MoleculeMatcher.get_rmsd方法的2個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: test_get_rmsd
# 需要導入模塊: from pymatgen.analysis.molecule_matcher import MoleculeMatcher [as 別名]
# 或者: from pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher import get_rmsd [as 別名]
def test_get_rmsd(self):
mm = MoleculeMatcher()
mol1 = Molecule.from_file(os.path.join(test_dir, "t3.xyz"))
mol2 = Molecule.from_file(os.path.join(test_dir, "t4.xyz"))
self.assertEqual('{0:7.3}'.format(mm.get_rmsd(mol1, mol2)), "0.00488")示例2: test_get_rmsd
# 需要導入模塊: from pymatgen.analysis.molecule_matcher import MoleculeMatcher [as 別名]
# 或者: from pymatgen.analysis.molecule_matcher.MoleculeMatcher import get_rmsd [as 別名]
def test_get_rmsd(self):
mm = MoleculeMatcher()
mol1 = BabelMolAdaptor.from_file(os.path.join(test_dir, "t3.xyz")).pymatgen_mol
mol2 = BabelMolAdaptor.from_file(os.path.join(test_dir, "t4.xyz")).pymatgen_mol
self.assertEqual('{0:7.3}'.format(mm.get_rmsd(mol1, mol2)), "0.00488")