本文整理匯總了Python中paleomix.common.formats.msa.MSA.to_file方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python MSA.to_file方法的具體用法？Python MSA.to_file怎麽用？Python MSA.to_file使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類paleomix.common.formats.msa.MSA的用法示例。
在下文中一共展示了MSA.to_file方法的1個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。
示例1: test_msa_to_file__complete_line_test
# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import to_file [as 別名]
def test_msa_to_file__complete_line_test():
msa = MSA([FASTA("barfoo", None, "ACGATA" * 10 + "CGATAG" * 5),
FASTA("foobar", None, "CGAATG" * 10 + "TGTCAT" * 5)])
expected = ">barfoo\n%s\n%s\n" % ("ACGATA" * 10, "CGATAG" * 5)
expected += ">foobar\n%s\n%s\n" % ("CGAATG" * 10, "TGTCAT" * 5)
stringf = StringIO.StringIO()
MSA.to_file(msa, stringf)
assert_equal(stringf.getvalue(), expected)