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Python MSA.from_lines方法代碼示例

本文整理匯總了Python中paleomix.common.formats.msa.MSA.from_lines方法的典型用法代碼示例。如果您正苦於以下問題：Python MSA.from_lines方法的具體用法？Python MSA.from_lines怎麽用？Python MSA.from_lines使用的例子？那麽, 這裏精選的方法代碼示例或許可以為您提供幫助。您也可以進一步了解該方法所在類paleomix.common.formats.msa.MSA的用法示例。


在下文中一共展示了MSA.from_lines方法的6個代碼示例，這些例子默認根據受歡迎程度排序。您可以為喜歡或者感覺有用的代碼點讚，您的評價將有助於係統推薦出更棒的Python代碼示例。

示例1: test_msa_from_lines__empty_name

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__empty_name():
    MSA.from_lines([">", "ACG", ">seq1", "TGAN"])
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:4，代碼來源:msa_test.py

示例2: test_msa_from_lines__mismatched_lengths

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__mismatched_lengths():
    MSA.from_lines([">seq1", "ACG", ">seq2", "TGAN"])
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:4，代碼來源:msa_test.py

示例3: test_msa_from_lines__duplicate_names

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__duplicate_names():
    MSA.from_lines([">seq1", "ACG", ">seq1", "TGA"])
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:4，代碼來源:msa_test.py

示例4: test_msa_from_lines__two_entries_with_meta

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__two_entries_with_meta():
    lines = [">seq1", "ACG", ">seq2 Second meta", "TGA"]
    expected = MSA([FASTA("seq1", None, "ACG"),
                    FASTA("seq2", "Second meta", "TGA")])
    result = MSA.from_lines(lines)
    assert_equal(result, expected)
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:8，代碼來源:msa_test.py

示例5: test_msa_from_lines__single_entry_with_meta

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__single_entry_with_meta():
    lines = [">seq1 Meta info", "ACG"]
    expected = MSA([FASTA("seq1", "Meta info", "ACG")])
    result = MSA.from_lines(lines)
    assert_equal(result, expected)
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:7，代碼來源:msa_test.py

示例6: test_msa_from_lines__single_entry

# 需要導入模塊: from paleomix.common.formats.msa import MSA [as 別名]
# 或者: from paleomix.common.formats.msa.MSA import from_lines [as 別名]
def test_msa_from_lines__single_entry():
    lines = [">seq1", "ACG"]
    result = MSA([FASTA("seq1", None, "ACG")])
    assert_equal(MSA.from_lines(lines), result)
開發者ID:MikkelSchubert，項目名稱:paleomix，代碼行數:6，代碼來源:msa_test.py


注：本文中的paleomix.common.formats.msa.MSA.from_lines方法示例由純淨天空整理自Github/MSDocs等開源代碼及文檔管理平台，相關代碼片段篩選自各路編程大神貢獻的開源項目，源碼版權歸原作者所有，傳播和使用請參考對應項目的License；未經允許，請勿轉載。