Python sklearn RadiusNeighborsTransformer用法及代码示例

本文简要介绍python语言中 sklearn.neighbors.RadiusNeighborsTransformer 的用法。

用法:

class sklearn.neighbors.RadiusNeighborsTransformer(*, mode='distance', radius=1.0, algorithm='auto', leaf_size=30, metric='minkowski', p=2, metric_params=None, n_jobs=1)

将 X 转换为比半径更近的邻居的(加权)图。

转换后的数据是由 radius_neighbors_graph 返回的稀疏图。

在用户指南中阅读更多信息。

参数：

mode：{‘distance’, ‘connectivity’}，默认='距离'

返回矩阵的类型：‘connectivity’ 将返回具有 1 和 0 的连接矩阵，‘distance’ 将根据给定度量返回邻居之间的距离。

radius：浮点数，默认=1.0

变换后的稀疏图中的邻域半径。

algorithm：{‘auto’, ‘ball_tree’，‘kd_tree’, ‘brute’}，默认='自动'

用于计算最近邻的算法：

• ‘ball_tree’ 将使用 BallTree
• ‘kd_tree’ 将使用 KDTree
• ‘brute’ 将使用蛮力搜索。
• ‘auto’ 将尝试根据传递给 fit 方法的值来决定最合适的算法。

注意：拟合稀疏输入将使用蛮力覆盖此参数的设置。

leaf_size：整数，默认=30

叶大小传递给BallTree 或 KDTree。这会影响构建和查询的速度，以及存储树所需的内存。最佳值取决于问题的性质。

metric：str 或可调用，默认='minkowski'

用于距离计算的度量。可以使用来自 scikit-learn 或 scipy.spatial.distance 的任何度量。

如果 metric 是一个可调用函数，则在每对实例(行)上调用它并记录结果值。可调用对象应将两个数组作为输入并返回一个值，指示它们之间的距离。这适用于 Scipy 的指标，但效率低于将指标名称作为字符串传递。

不支持距离矩阵。

指标的有效值为：

• 来自scikit-learn：[‘cityblock’, ‘cosine’, ‘euclidean’，‘l1’, ‘l2’，‘manhattan’]
• 来自 scipy.spatial.distance: [‘braycurtis’, ‘canberra’, ‘chebyshev’, ‘correlation’, ‘dice’, ‘hamming’, ‘jaccard’, ‘kulsinski’, ‘mahalanobis’, ‘minkowski’, ‘rogerstanimoto’, ‘russellrao’, ‘seuclidean’, ‘sokalmichener’, ‘sokalsneath’, ‘sqeuclidean’, ‘yule’]

有关这些指标的详细信息，请参阅scipy.spatial.distance 的文档。

p：整数，默认=2

来自 sklearn.metrics.pairwise.pairwise_distances 的 Minkowski 度量的参数。当 p = 1 时，这相当于使用 manhattan_distance (l1)，而对于 p = 2，则使用 euclidean_distance (l2)。对于任意 p，使用 minkowski_distance (l_p)。

metric_params：字典，默认=无

度量函数的附加关键字参数。

n_jobs：整数，默认=1

为邻居搜索运行的并行作业数。如果 -1 ，则作业数设置为 CPU 内核数。

属性：

effective_metric_：str 或可调用

使用的距离度量。它将与 metric 参数或其同义词相同，例如‘euclidean’ 如果 metric 参数设置为 ‘minkowski’ 并且 p 参数设置为 2。

effective_metric_params_：dict

度量函数的附加关键字参数。大多数指标与metric_params 参数相同，但如果effective_metric_ 属性设置为‘minkowski’，也可能包含p 参数值。

n_features_in_：int

拟合期间看到的特征数。

feature_names_in_：ndarray 形状(n_features_in_，)

拟合期间看到的特征名称。仅当 X 具有全为字符串的函数名称时才定义。

n_samples_fit_：int

拟合数据中的样本数。

例子：

>>> import numpy as np
>>> from sklearn.datasets import load_wine
>>> from sklearn.cluster import DBSCAN
>>> from sklearn.neighbors import RadiusNeighborsTransformer
>>> from sklearn.pipeline import make_pipeline
>>> X, _ = load_wine(return_X_y=True)
>>> estimator = make_pipeline(
...     RadiusNeighborsTransformer(radius=42.0, mode='distance'),
...     DBSCAN(eps=25.0, metric='precomputed'))
>>> X_clustered = estimator.fit_predict(X)
>>> clusters, counts = np.unique(X_clustered, return_counts=True)
>>> print(counts)
[ 29  15 111  11  12]