本文整理汇总了Python中utils.Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的具体用法?Python Atom_utils._get_atom_name_from_index怎么用?Python Atom_utils._get_atom_name_from_index使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类utils.Atom_utils
的用法示例。
在下文中一共展示了Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_ring_bb_atoms
# 需要导入模块: from utils import Atom_utils [as 别名]
# 或者: from utils.Atom_utils import _get_atom_name_from_index [as 别名]
def test_ring_bb_atoms(self):
ring_potential = self.make_ring_potential()
ring_table = Table_manager.get_default_table_manager().get_ring_table('PHE')
target_atoms = ring_table.get_target_atoms()
all_component_names = ring_potential._get_component_list('ATOM').get_all_components()
all_component_names_index = dict((i,atom_name) for i,atom_name in enumerate(target_atoms))
for atom_id,atom_type_id in all_component_names:
segment,residue_number,atom_name = Atom_utils._get_atom_info_from_index(atom_id)
self.assertEqual(segment, '')
self.assertEqual(residue_number, 2)
atom_name = Atom_utils._get_atom_name_from_index(atom_id)
self.assertEqual(all_component_names_index[atom_type_id], atom_name)
del all_component_names_index[atom_type_id]
self.assertEmpty(all_component_names_index)