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Python Atom_utils._get_atom_name_from_index方法代码示例

本文整理汇总了Python中utils.Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的具体用法?Python Atom_utils._get_atom_name_from_index怎么用?Python Atom_utils._get_atom_name_from_index使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在utils.Atom_utils的用法示例。


在下文中一共展示了Atom_utils._get_atom_name_from_index方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_ring_bb_atoms

# 需要导入模块: from utils import Atom_utils [as 别名]
# 或者: from utils.Atom_utils import _get_atom_name_from_index [as 别名]
    def test_ring_bb_atoms(self):
        ring_potential = self.make_ring_potential()



        ring_table = Table_manager.get_default_table_manager().get_ring_table('PHE')
        target_atoms = ring_table.get_target_atoms()

        all_component_names = ring_potential._get_component_list('ATOM').get_all_components()
        all_component_names_index = dict((i,atom_name) for i,atom_name in enumerate(target_atoms))
        for atom_id,atom_type_id in all_component_names:
            segment,residue_number,atom_name = Atom_utils._get_atom_info_from_index(atom_id)
            self.assertEqual(segment, '')
            self.assertEqual(residue_number, 2)
            atom_name  = Atom_utils._get_atom_name_from_index(atom_id)
            self.assertEqual(all_component_names_index[atom_type_id], atom_name)

            del all_component_names_index[atom_type_id]
        self.assertEmpty(all_component_names_index)
开发者ID:locsmith,项目名称:xcamshift,代码行数:21,代码来源:test_xcamshift_afa.py


注:本文中的utils.Atom_utils._get_atom_name_from_index方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。