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Python Track.add_params方法代码示例

本文整理汇总了Python中track.Track.add_params方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Track.add_params方法的具体用法?Python Track.add_params怎么用?Python Track.add_params使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在track.Track的用法示例。


在下文中一共展示了Track.add_params方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: samples2view

# 需要导入模块: from track import Track [as 别名]
# 或者: from track.Track import add_params [as 别名]
    def samples2view(self, samples, view, stranded=False, template="%s_tag",
        setColor=False, colorByStrand=True):
        self.cpt.add_view(view)
        tracktype = view.tracktype
        viewtype = view.view

        suffix = self.tracktype2suffix(tracktype)
        for sample, strand in self.iter_samples(samples, stranded):
            samplename = sample
            if stranded:
                samplename = sample+'_'+strand

            basename = template % (samplename,)
            self.priority += self.priority_step
            track = Track(
                tracktype=tracktype,
                name='%s%s%s' % (self.name, viewtype, samplename),
                url=os.path.join(self.name, basename+'.'+suffix),
                shortLabel='%s %s' % (samplename, viewtype),
                longLabel="%s %s" % (samplename, viewtype),
                priority=self.priority,
                )
            sys.stderr.write(str(track)+"\n")
            if stranded and tracktype == "bigWig" and strand in ("-", "rev"):
                track.add_params(negateValues="on")

            if tracktype == "bigWig":
                track.add_params(maxHeightPixels="100:50:8")

            if setColor:
                if colorByStrand and strand in self.strand2color:
                    track.add_params(color=self.strand2color[strand])
                else:
                    idx = samples.index(sample) % len(ExpTrack.COLORS)
                    track.add_params(color=ExpTrack.COLORS[idx])

            view.add_tracks(track)
开发者ID:zhouyu,项目名称:trackhub,代码行数:39,代码来源:userhub.py


注:本文中的track.Track.add_params方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。