本文整理汇总了Python中species.Species.getSpeciesName方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Species.getSpeciesName方法的具体用法?Python Species.getSpeciesName怎么用?Python Species.getSpeciesName使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类species.Species
的用法示例。
在下文中一共展示了Species.getSpeciesName方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: __init__
# 需要导入模块: from species import Species [as 别名]
# 或者: from species.Species import getSpeciesName [as 别名]
def __init__(self, db_name):
"""db_name: and Emsembl database name"""
if isinstance(db_name, EnsemblDbName):
db_name = db_name.Name
self.Name = db_name
self.Type = get_dbtype_from_name(db_name)
self.Prefix = get_db_prefix(db_name)
release, build = get_version_from_name(db_name)
self.Release = release
self.GeneralRelease = self.Release
if len(build) == 1:
if self.Type != 'compara':
self.Build = build[0]
else:
self.Build = None
self.GeneralRelease = build[0]
elif build:
self.Build = build[1]
self.GeneralRelease = build[0]
else:
self.Build = None
self.Species = None
self.Species = Species.getSpeciesName(self.Prefix)