本文整理汇总了Python中skbio.TreeNode.tips方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TreeNode.tips方法的具体用法？Python TreeNode.tips怎么用？Python TreeNode.tips使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类skbio.TreeNode的用法示例。
在下文中一共展示了TreeNode.tips方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: filter_table
# 需要导入模块: from skbio import TreeNode [as 别名]
# 或者: from skbio.TreeNode import tips [as 别名]
def filter_table(table: biom.Table, tree: skbio.TreeNode) -> biom.Table:
""" Filter table to remove feature ids that are not tip ids in tree
"""
tip_ids = set([t.name for t in tree.tips()])
feature_ids = set(table.ids(axis='observation'))
# ids_to_keep can only include ids that are in table
ids_to_keep = tip_ids & feature_ids
table.filter(ids_to_keep, axis='observation', inplace=True)
return table